Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2J2Q9GZM3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms