Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LNPKQ9C0E8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LNPKQ9C0E8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms