Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUS3Q9BZE2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PUS3Q9BZE2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUS3Q9BZE2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms