Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NSD3Q9BZ95 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSD3Q9BZ95 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NSD3Q9BZ95 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms