Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLDIP3Q9BY77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLDIP3Q9BY77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms