Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC12A9Q9BXP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A9Q9BXP2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A9Q9BXP2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms