Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PBDC1Q9BVG4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms