Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms