Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms