Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT11Q9BT88 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT11Q9BT88 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms