Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms