Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NICN1Q9BSH3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NICN1Q9BSH3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms