Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG101Q9BSB4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG101Q9BSB4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms