Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM56Q9BRZ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM56Q9BRZ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms