Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PYM1Q9BRP8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYM1Q9BRP8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYM1Q9BRP8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms