Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAAF1Q9BRP4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms