Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FYCO1Q9BQS8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FYCO1Q9BQS8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FYCO1Q9BQS8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms