Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HEPHQ9BQS7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HEPHQ9BQS7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms