Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms