Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHDC3Q9BQ90 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms