Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CITED1Q99966 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms