Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms