Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms