Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
YME1L1Q96TA2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms