Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SIN3AQ96ST3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms