Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAPLN3Q96S86 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HAPLN3Q96S86 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms