Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRAMP1Q96RY5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRAMP1Q96RY5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms