Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CICQ96RK0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CICQ96RK0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms