Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IPQ96QF0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3IPQ96QF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms