Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms