Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ARAP1Q96P48 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARAP1Q96P48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms