Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf49Q96NF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms