Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf66Q96MD2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms