Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC138Q96M89 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC138Q96M89 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms