Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RMDN2Q96LZ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms