Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX27Q96L92 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms