Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX3Q96JJ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX3Q96JJ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms