Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF496Q96IT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF496Q96IT1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF496Q96IT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms