Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP2Q96HF1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms