Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BICD1Q96G01 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BICD1Q96G01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BICD1Q96G01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BICD1Q96G01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BICD1Q96G01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms