Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT43Q96FT9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms