Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms