Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21BQ96EK2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHF21BQ96EK2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF21BQ96EK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms