Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4CQ96DT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms