Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC39Q96DD0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC39Q96DD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms