Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms