Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms