Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK4Q96C45 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ULK4Q96C45 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ULK4Q96C45 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms