Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC28Q96AY4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms