Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXPE3Q969Y0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPE3Q969Y0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPE3Q969Y0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms